簡(jiǎn)要描述：產(chǎn)品名稱：KAPA hgDNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號(hào)：KK4960
產(chǎn)品規(guī)格：300反應(yīng)

產(chǎn)品介紹：　

  KAPA hgDNA定量&QC試劑盒，包含人類基因組DNA樣品NGS文庫(kù)構(gòu)建前，所有基于qPCR定量及質(zhì)量評(píng)估的試劑。

  KAPA hgDNA定量&QC試劑盒，是基于SYBR Green I染料法優(yōu)化的高質(zhì)量qPCR檢測(cè)試劑盒，包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix預(yù)先稀釋的一系列DNA標(biāo)準(zhǔn)品，以及針對(duì)于人類基因組單拷貝的高度保守區(qū)域的不同位點(diǎn)所設(shè)計(jì)的引物預(yù)混液。最小片段所對(duì)應(yīng)的引物，用于獲得絕對(duì)定量的結(jié)果，而額外的引物，用于獲得在DNA樣本中可擴(kuò)增模板量(質(zhì)量高的核酸片段)的信息。這個(gè)試劑盒由此所產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(即Q-ratios)，可以用于預(yù)測(cè)文庫(kù)的產(chǎn)量，或者對(duì)于如FFPE DNA這類樣本質(zhì)量變化很大的樣本的工作流程進(jìn)行調(diào)整。

產(chǎn)品名稱：KAPA hgDNA定量及QC試劑盒

產(chǎn)品貨號(hào)：KK4960

產(chǎn)品特點(diǎn)：

在單次檢測(cè)中，同時(shí)評(píng)估樣本量以及樣本質(zhì)量

可以將質(zhì)量分?jǐn)?shù)(Q-ratios)與測(cè)序相關(guān)指標(biāo)相關(guān)聯(lián)

高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix

預(yù)先稀釋好的DNA標(biāo)準(zhǔn)品以及可以直接使用的引物

多功能、易于自動(dòng)化的工作流程

產(chǎn)品原理：

一組DNA標(biāo)準(zhǔn)品，使用三對(duì)不同引物，用于產(chǎn)生(最多)三組標(biāo)準(zhǔn)曲線。這三對(duì)引物的擴(kuò)增目標(biāo)，位于某高度保守、單拷貝的人類基因組位點(diǎn)，其大小分別為41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp檢測(cè)用于DNA樣品的絕對(duì)定量。對(duì)于評(píng)估DNA質(zhì)量，使用129 bp和/或305 bp引物預(yù)混液生成標(biāo)準(zhǔn)曲線并且檢測(cè)樣本。由于低質(zhì)量的DNA樣本的長(zhǎng)片段擴(kuò)增效率會(huì)大幅度降低，相對(duì)的DNA質(zhì)量可以通過(guò)41 bp檢測(cè)的濃度，對(duì)于129 bp或者305 bp檢測(cè)的濃度進(jìn)行均一化，或者在此DNA樣本中可被擴(kuò)增的物質(zhì)的量來(lái)進(jìn)行推測(cè)。這種通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(值介于0和1之間)，可以用于指示DNA的質(zhì)量，或者在此DNA樣本中可被擴(kuò)增的物質(zhì)的量。

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)：

指示樣品是否有足夠的量以及質(zhì)量來(lái)成功構(gòu)建文庫(kù)

未通過(guò)質(zhì)控的樣本，不再進(jìn)行后續(xù)文庫(kù)構(gòu)建以及測(cè)序步驟，從而節(jié)約時(shí)間和精力

使用預(yù)期：

Q129/41 比值和測(cè)序中的關(guān)鍵指標(biāo)（如重復(fù)率）具有相關(guān)性

從250 ng Covaris打斷的FFPE DNA樣本(n=14)和對(duì)照組DNA(分別從培養(yǎng)細(xì)胞、新鮮冰凍樣本和血液中提取，n=6)，進(jìn)行手動(dòng)文庫(kù)構(gòu)建。樣本按照Q129/41-比例升序在x軸上從左至右排列(FFPE樣本用黃色表示，對(duì)照組DNA用橙色表示)。文庫(kù)構(gòu)建采用的是NEBNext® 試劑(New England Biolabs)，其中靶標(biāo)捕獲前和靶標(biāo)捕獲后的擴(kuò)增環(huán)節(jié)(10個(gè)循環(huán))采取KAPA HiFi 試劑盒。靶標(biāo)捕獲使用的是定制的SeqCap EZ panel (300 genes,0.9 MB)。 在Illumina HiSeq平臺(tái)上進(jìn)行了測(cè)序(2 x 100 bp)。FFPE樣本的平均靶標(biāo)覆蓋率(藍(lán)色點(diǎn))是對(duì)照組的四倍(1,247X, vs. 301X)，平均重復(fù)率(紅色點(diǎn))是對(duì)照組的兩倍(75% vs. 38%)。Q129/41 比值 > 0.4 的FFPE樣本所產(chǎn)出的文庫(kù)能夠達(dá)到測(cè)序質(zhì)量要求。

產(chǎn)品訂購(gòu)信息

產(chǎn)品名稱：KAPA hgDNA定量及QC試劑盒

產(chǎn)品貨號(hào)：KK4960

關(guān)于公司：

Kapa Biosystems位于美國(guó)馬薩諸塞州威爾明頓，是一家蛋白質(zhì)工程專家及基因組學(xué)工具供應(yīng)商，致力于研發(fā)、生產(chǎn)下一代測(cè)序（NGS）所需的生物酶及相關(guān)試劑，該公司基于直接分子進(jìn)化平臺(tái)開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品已被廣泛用于DNA擴(kuò)增、測(cè)序、基因組學(xué)研究、分子診斷等領(lǐng)域。

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