Streck品牌cfDNA采血管的穩(wěn)定性分享

 　　Streck品牌cfDNA采血管的穩(wěn)定性分享

　　Streck品牌cfDNA采血管可實(shí)現(xiàn)全血采集樣品中cfDNA規(guī)范化(標(biāo)準(zhǔn)化)。可用于無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因篩查/無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)(NIPS/NIPT)和液體生物監(jiān)測(cè)(液體活檢，Liquid Biopsy)的規(guī)范化，提高檢驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。

　　1. 時(shí)間穩(wěn)定性(Time Stability)

　　CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血，其Cell-free DNA可以在室溫(22?C) 下能穩(wěn)定保存長(zhǎng)達(dá)28天!

　　結(jié)論來(lái)自如下監(jiān)測(cè)：在不同時(shí)間下，對(duì)室溫保存在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中的血液，取血漿使用droplet digital PCR檢測(cè)β-Actin基因片段，用以反映cell-free DNA濃度，發(fā)現(xiàn)與初始采集時(shí)比較，保存長(zhǎng)達(dá)28天后該基因沒(méi)有發(fā)生顯著改變。而K3EDTA采血管無(wú)法實(shí)現(xiàn)在室溫下的長(zhǎng)時(shí)間保存。在第3天，β-Actin已經(jīng)呈現(xiàn)顯著升高，cell-free DNA濃度持續(xù)升高，至28天時(shí)，濃度升高上千倍之多。

　　2. ctDNA穩(wěn)定性

　　Blood Exo DNA ProTeck® tubes保存血樣，血液中的腫瘤DNA室溫(22?C)穩(wěn)定保存28天。

　　該結(jié)果來(lái)自于對(duì)野生型KRAS DNA濃度的檢測(cè)：Blood Exo DNA ProTeck® tubes能讓血液中的KRAS DNA室溫(22?C)穩(wěn)定保存28天，而K3EDTA保存管無(wú)法實(shí)現(xiàn)。

　　將來(lái)源于細(xì)胞系的已知量的KRAS外顯子2 G13D突變的腫瘤cell-free DNA作為內(nèi)參照加入到采集的血樣中，使用therasreen KRAS RGQ PCR試劑盒和Rotor Gene real time PCR儀檢此內(nèi)參。在K3EDTA采血管保存的血樣中，發(fā)現(xiàn)僅在采集日可以檢出，而B(niǎo)lood Exo DNA ProTeck® tubes中保存的血樣，22°C下保存28天依舊可以檢出。

　　3. 溫度穩(wěn)定性(Temperature stability)

　　使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血在4?C到30?C間都能保持cell-free DNA穩(wěn)定。

　　無(wú)論使用Qubit® dsDNA HS檢測(cè)法，還是使用droplet digital PCR檢測(cè)RASSF1A，在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中，6?C, 22?C或37?C三種保存溫度下保存的血液，直到第7天cell-free DNA濃度都沒(méi)有顯著改變。

　　4. 運(yùn)輸穩(wěn)定性(Shipping stability)

　　使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集保存的血樣能經(jīng)受42?C溫度，不影響血中cell-free DNA濃度。

　　實(shí)驗(yàn)方法：將ProTeck采血管采集的血樣，通過(guò)FedEx運(yùn)輸往哥倫比亞，亞利桑那等地，經(jīng)受兩天42?C，與室溫保存的樣品比較cell-free DNA濃度沒(méi)有顯著改變，而在K3EDTA管中保存的血樣cell-free DNA濃度顯著升高(droplet digital PCR技術(shù)檢測(cè)β-Actin基因片段)。

　　5.甲醛檢測(cè)

　　NMR檢測(cè)顯示CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tube不含甲醛。